作為環(huán)境監(jiān)測中的重要檢測儀器，離子色譜法是水質(zhì)、大氣、土壤監(jiān)測的重要檢驗方法，具有穩(wěn)定性好、重現(xiàn)性好、精密度好等特點，尤其在水質(zhì)監(jiān)測有著廣泛的應(yīng)用。

對于降水的監(jiān)測是環(huán)境監(jiān)測中的一個重要工作，離子色譜在降水常規(guī)監(jiān)測中發(fā)揮重要作用。在進行降水監(jiān)測離子的測定時，使用離子色譜儀進行可以有效的減少檢驗時間，增加檢驗準確性。

對于環(huán)境水質(zhì)的分析也是環(huán)境監(jiān)測的重要工作之一，采用離子色譜儀一般可以在20分～30分鐘之內(nèi)分析測試出常規(guī)項目：氟化物、氯化物、亞硝酸鹽氮硝酸鹽氮、硫酸鹽等。通過標(biāo)準溶液的配制選擇適合的濃度，配成多個項目的混合使用液，繪制標(biāo)準曲線，通過標(biāo)準曲線對環(huán)境水質(zhì)樣品進行定量分析，其精密度、準確度均達到環(huán)境監(jiān)測實驗室質(zhì)量控制指標(biāo)的要求。

傳統(tǒng)城市污水監(jiān)測，針對不同的監(jiān)測指標(biāo)有不同的方法，以硫酸鹽為例，硫酸鹽的測定其傳統(tǒng)推薦方法為GB/T11899-1989重量法，該方法準確度高但操作繁瑣且耗時較長。而離子色譜法作為一種新的分析技術(shù)廣泛應(yīng)用于水中常見陰離子和堿金屬、堿土金屬陽離子分析，較傳統(tǒng)方法省時省力、操作簡便。而且利用城市污水離子色譜前處理柱系統(tǒng)可有效去除污水中的有機質(zhì)及少量的重金屬離子，減少了對色譜柱柱效的影響，該方法能*對城市污水監(jiān)測的要求。在進行城市污水監(jiān)測及工業(yè)廢水監(jiān)測過程中要格外注意對有機質(zhì)的去除，以保障檢測結(jié)果的準確。

在進行污染源水樣監(jiān)測時，離子色譜由于其分離柱的特性導(dǎo)致在進行樣品分析前必須對樣品進行處理，以保護分離柱不被損壞。在進行土樣等固體監(jiān)測樣品時，需經(jīng)過超聲波、溶液浸泡等提取離子于溶液中，再進行處理后進行分析。